La serie "Flora & Fauna" di Diageo fu lanciata nel 1991, comprendendo 22 whisky single malt. La serie rappresentò un'opportunità per gli allora proprietari, United Distillers, di presentare il proprio portfolio. Nel caso di Clynelish , tuttavia, la serie rappresentò l'occasione per rilanciare un marchio.

Il successo di questo Clynelish 14 anni Flora & Fauna spinse Diageo, proprietaria della distilleria, a rinnovare il marchio nel 2002. La Clynelish come la conosciamo oggi fu fondata nel 1967 come distilleria gemella di Brora (originariamente chiamata Clynelish). Per un certo periodo, la nuova distilleria si dedicò principalmente alla produzione di blend. Tuttavia, nel 2002, il 14 anni fu lanciato ufficialmente come riimbottigliamento del Flora & Fauna.